第二核能發電站
核一廠、核二廠與臺北市的直線距離分別只有28和22千米，雖有地形因素等與山脈的天然屏障，能避免發生嚴重意外時產生直接沖擊，但仍可能造成重大事故。核一廠與核二廠位在第二類斷層山腳斷層附近，不過研究指出一旦該斷層引發強烈地震，核電站的耐震能力仍足以安全停機，不會引起危害。根據原能會最新研究，如果兩座反應器一起出問題，緊急應變範圍為8千米，而部分專家指出需疏散30千米之居民才得以保障安全並避免沖擊擴大。
曾於1990年代發生秘雕魚事件。事件主因是水溫升高，而導致魚體攝取維生素C與膠原蛋白中的羥脯胺酸不足，妨礙骨骼與肌肉的發育。
2011年（民國100年）10月，核二廠2號機組於大修期間，目視發現120根反應堆支撐裙鈑錨定螺栓之中，有一根螺栓斷裂。其余119根螺栓經超音波探傷檢驗後確認無斷裂或裂紋之情事。
2012年（民國101年）3月，同廠1號機組於大修期間，執行清潔作業時發現位於裙鈑內側1根螺栓斷裂。經超音波探傷檢測後再次發現裙板內側另有2根螺栓已近斷裂，另有4根螺栓有裂紋顯示，裂紋深度約 2.5 毫米。外側螺栓檢測則無異常現象。經核能研究所熱室檢驗分析斷裂之螺栓後發現，螺栓斷裂之原因可初步排除腐蝕因素；並可能肇因於熱處理不當、材質不良、製程瑕疵及因螺桿與載鈑接觸引發之非預期彎曲力矩等現象。